Es nombrado de esta manera el 14 de Marzo 1887 por la reconocida figura del General Francisco Morazán. Al principio se le reconocía como ciudad en 1877 y hasta 1885 se le reconoce como departamento.

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El departamento tiene diversas tradiciones culturales y artesanales. Se realizan bailes y danzas autóctonas como: Los Emplumados, Los Negritos, Los Tapojiados de Cacaopera y La Yeguita de Chilanga.

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Morazán es un Departamento de El Salvador, ubicado en la zona oriental del país, el cual aún conserva rastros de la presencia de paleo indios: los primeros pobladores de la zona que dejaron sus rastros en lugares preservados hasta la actualidad como la Cueva del Espíritu Santo.